十二藥師	薬師霊場記　貞享２年(1685)

薬師霊場記			現在
第一	石藥師[1]	寺町真如堂之内	真如堂　石薬師堂／石薬師 ※ 元禄６年(1693)、京極今出川から現在地へ移転
第二	芝藥師	同町下之甼	大興寺／芝（しばの）薬師 ※ 元禄６年(1693)、京極今出川から現在地へ移転
第三	小屋藥師	同一条盧山寺之内	廬山寺／小屋の薬師
第四	嶺之藥師	同福勝寺之内	福勝寺／峰薬師 ※ 宝永５年(1708)の焼亡後、現在地へ移転
第五	塔之藥師	同誓願寺之内	誓願寺／薬師如来像は三重塔とともに天明８年(1788)焼失
第六	蛸やくし	同南通り	永福寺[2]／蛸薬師
第七	祇園藥師	七佛之其一	「観慶寺[3]」廃寺　／薬師如来像は大蓮寺へ ※ 明治初年の神仏分離
第八	東山藥師	双林寺之内	双林寺／東山薬師
第九	因幡藥師	七佛之其一	平等寺／因幡薬師
第十	布袋藥師	白山通二条上ル町	大福寺／菩提（ぼたい、ほてい）薬師
第十一	こぬか藥師	釜之座二条上ル町	薬師院／こぬか薬師
第十二	北野藥師	天神御社よりひかし	「徳勝院[4]」廃寺 ※ 明治初年の神仏分離

[1]	京都御苑の北東にある石薬師門、石薬師通、真如堂前町、真如堂突抜町などの名称・地名は、当時、京極（寺町通）今出川下ルにあった真如堂と石薬師に由来します。
[2]	永福寺は、天正１９年(1591)頃から円福寺に合併されていましたが、現在は再び永福寺として独立し、蛸薬師がご本尊となっています。
[3]	観慶寺（かんぎょうじ）は別名を祇園寺と言い、その寺域内にあった天神堂がのちの祇園社（八坂神社）となりました。 「花洛名勝図会（東山之部一 ）」の祇園社の項に以下の記述があります。 「観慶寺　本殿の西にあり　薬師堂といふ」
[4]	元禄６年(1693)頃の洛中を描いた「洛中絵図」を見ると、北野天神の東側（現・上京区社家長屋町）に「徳勝院」があります。 「徳勝院」は北野三宮司の一つで、明治維新の神仏分離で「松梅院」「妙蔵院」とともに廃されました。