奈良・天理市の東端、布留（ふる）山（やま）の麓に建つ。 境内には日本最古の道とされる「山の辺の道」が走り、周囲は国内有数の古墳の密集地帯。 境内には樹齢３００年を超す杉の木が立ち並び、どことなく神代の雰囲気が漂う境内だ。

　境内の一段高いところに楼門、その奥に白河天皇（１０５３〜１１２９）が宮中にあった神嘉（しんか）殿（でん）を寄進したと伝えられる拝殿がある。 拝殿は日本最古のもので、使用されているのは平安時代の木材。 国宝に指定されている。

　拝殿奥に建つ本殿は大正時代に建てられたもの。 というのも、石上神宮はもともと本殿をもたない神社で、その地は古くから禁足地としてあがめられていた。 御神体である神剣「韴霊（ふつのみたま）」が禁足地の地中深くにまつられているという伝承を確かめるべく、１８７４年に当時の大宮司が調査した結果、実際に多くの玉、剣、矛（ほこ）などとともに神剣も発見。 これをまつるために建立されたのが現在の本殿だ。 ちなみに、神剣が顕れたのは本殿と拝殿の間。現在は大石が置かれている。